Hoje eu participei de um curso qude duração de um dia dem primeiros socorros para o meu trabalho.

Foi muito interessante, aprendi muito.

Só que, me deixou bastante cansada, especialmente quando tivemos que praticar RCP.

Nunca separe "só que" do restante da frase, a menos que seja uma pausa explicativa, como em:
Eu não tenho dinheiro, só que tenho contas a pagar.
Eu não tenho dinhiero, só que, apesar disso, tenho contas a pagar.