量子コンピューターとは、これまでのコンピューターとは異なる（理論/論理）を情報処理に応用した機械である。

下に引用した部分から、ここは、「理論」もしくは、「論理」をヲ格に取るのが適切と判断しました。

「それに対し、量子コンピューターは量子力学を基にした特別な論理で、古典論では説明が困難である「量子ビット」により情報を処理する。」

現在普及しているパソコンなどのコンピューターは、電子回路のスイッチの「オン・オフ」によって「0」と「１」の二つの状態を2進数のデジタルデーターとして情報を処理している。

「データ」が一般的です。
「二つ」は、横書きですが、公文書等では漢字表記を採用しています。そのままで大丈夫です。（「新しい国語表記ハンドブック　第八版　p258/三省堂/2018」参照）

それに対し、量子コンピューターは量子力学を基にした特別な論理論で、古典論では説明が困難である「量子ビット」により情報を処理する。

量子コンピューターとは、これまでのコンピューターとは異なる情報処理に方法を応用した機械である。

現在普及しているパソコンなどのコンピューターは、電子回路のスイッチの「オン・オフ」によって「0」と「１」の二2つの状態を2進数のデジタルデーターとして情報を処理している。

それに対し、量子コンピューターは量子力学を基にした特別な論理論で、古典論では説明が困難である「量子ビット」により情報を処理する。