公式のローマ字の書き方法が変わると最近聞こえきました。

「方法」は単体ではあまり使わず、他の単語と合わせて使われることが多いです。（例：料理の方法、運転の方法、申請の方法）
「～方」という表現はよく日本語で使われるので、使ってみてください。（例：料理の仕方、運転の仕方、書き方）

説明が難しいですが、「聞こえました。」は、あなたがその話を直接少し遠くの会話から聞いた感じです。（例：カフェの隣の席から会話が聞こえました。）

今までは、訓令式は公式の方法だ文体だったけど、ヘップバーンも多いです。

「方法」は、手順を踏んだ一連のやり方を指すイメージなので、ここでは不自然に聞こえます。
「～だったけど」とすると、今までとこれからが違うことを強調できます。（例：今まではお酒を飲めなかったけど、これからは飲める）

訓令式は古い日本式に基づいたと文体だと、ある本で読みました。

「読みました」をもっと詳しく書いた方が、より自然に聞こえると思います。
また、「聞きました」でもOKです。（これは人やテレビのニュースで聞いた感じになります。）

最初に、日本式の目的はでは、日本人にローマ字を教えます。

「日本式の目的」の意味をしっかりと理解できなかったので、より自然に聞こえるように書いてみました。

そのため、五十音の類似については大切にしていました。

「類似」という単語は良いとは思いますが、「五十音の類似」という意味が良くわかりませんでした。
「大切にしました。」以外にも、「良いと思いました。」と書いてもOKです。
また、「していました」とすると、過去は大切にしていたが、今は大切にしていないことを強調できます。

かなと漢字を取り替える目的課題がありました。

これは予想ですが、何かの授業や練習で取り組んだ内容を書いていますか？
だとすると、「目的」は少し固く聞こえてしまうかもしれません。（例：旅の目的、結婚する目的）
「問題」「課題」「練習」等と書いたら、よりわかりやすくなるかもしれません。

今はその目的課題はありません。

信じにくくなりました。

文章の文法自体は特に問題ありません。
「～について信じにくくなりました。」と、より詳細に書くと、よりわかりやすくなるかもしれません。

逆にヘップバーンの目的は課題では、外国人に日本語を教えます。

少し細かいことですが、「～の課題では、～を教えます。」「～の課題は、～を教えることです。」というように書くと、自然な文章に聞こえます。

そのため、ヨーロッパの言語の発音の類似（英語こそ性（特に英語）は大切にしました。

「類似性」とすると、その性質について言及している様に聞こえます。
「～性」と書くことは、他にも適用できるので、試してみてください。

ちなみに、２０２４年でに日本語で「きんいろモザイク」のアニメを見ました。

それは最初の日本語で見た最初のアニメでした。

この語順の方が、自然に聞こえます。「最初」と「アニメ」を近くに置いた方が理解がしやすく聞こえます。
語順はとても難しく、日本人でもよく間違えることがあるので、そこまで気にする必要はない気もしますが。

このアニメの主人公達の中でに、二人のイギリス人がありいます。

「主人公」は基本一人という印象を感じたので、「～達」と複数人であることを書くと良いと思います。

あります：物に対して使う（例：リンゴが机の上にあります、本が地面に置いてあります）
います：人や生き物に対して使う（例：先生が教室にいます、ヤギが丘の上にいます）

まずに一つ人の日本人の主人公が留学生のなるためにイギリスに行って、イギリス人の友達を作りました。

一つ：物に対して使う
一人：人に対して使う
ちなみに、動物や植物に対して使う数の単位はもっと難しいので、ここでは省略します。
例：牛１頭、犬１匹、鳥１羽、花１輪

物語に従っが進むにつれて、一年にで日本語を知ったことになりました。

「物語に従って」とすると、台本などの最初から決まった流れ通りにすることを言います。
「～が進むにつれて」という日本語表現は、よく使うので、試してみてください。

しかし、そのうちの一つの間違いは訓令式のローマ字に基づきます。

「いくつかある間違いの一つ」という意味を加えました。
無くても意味は伝わりますが、より自然に聞こえるようにしました。

イギリスにで日本語を学べたから、訓令式を使いそううことはありません。

場所を言うときは、「～で」と書くことが多いです。（例：学校で、駅で、家で）
「使うことはありません」は断言しているような文章になり、少し曖昧で幅を持たせるためには「使うことは無さそうです」と書くことができます。

そのため、この間違いはなさそうと思いまをしてしまうことは無さそうです。

元の文章でも意味はもちろん通じます。
「間違い」自体は名詞なので、動詞を書くと、より文章を自然にできます。
（「間違いが無い」という文章はありますし、これは完璧な文章です。ただこれは目の前にある事に関して言及する印象が強いです。）

一つの分はイギリスの田舎に行いまついてです。

「一つの分」では無くて、「一つは」でOKです。

「田舎に行う」では文法が変になってしまうので、「田舎についての説明を行う」等の、「行う」対象を書く必要があります。

アニメにでは、めったにそんな景色を見ません。

「アニメに見る」という表現もありますが、「アニメで見る」として方が自然に聞こえると思います。

イギリスのアニメは２つの一種類があります。

小さい子供に向かう向けアニメと成人向けのコメディのアニメです。

「～向け」という表現はよく使います。まさしくこの文章のような内容で使います。

小さい子供向けのアニメでは大げさな景色は多いで、成人のコメディが多く、成人向けアニメではほとんど都会にありまが舞台です。

ちなみに、「大げさ」は無駄に派手な印象を受けるので、少しマイナスなイメージを含みます。

両方はとも、田舎のリーアルな景色は大切にしが描かれていません。

元の文章でも言いたいことはわかります。
「描かれていない」は、アニメ,映画,小説等に対して使うことができます。

祖母にが住んでいる村みたいな景色ですしたから。

「祖母」が主語になるので、「～が住んでいる」となります。
また、このアニメを見たのが過去なので、「～でしたから」としました。